Взаимное сотрудничество киргизских и башкирских предпринимателей при поддержке правительств Башкортостана и Киргизии привело к открытию организации. Это важный этап реализации национального проекта «Международная кооперация и экспорт», инициированного майским указом Владимира Путина.
В создании международной ассоциации предпринимателей «Торговый дом в Киргизской республике» активное участие принимал Государственный комитет Башкортостана по внешнеэкономическим связям. Некоммерческую организацию на добровольных началах возглавил представитель Государственного комитета Киргизской республики по внешнеэкономическим связям Кочконбай Майлубашов.
Деятельность Торгового дома нацелена на создание прочных торгово-экономических и культурных связей двух республик. В рамках его работы планируется продвигать башкирскую продукцию на рынках Киргизской республики, содействовать участию деловых кругов Башкирии в мероприятиях, которые проводятся на территории Киргизии, организовывать бизнес-туры и реализовывать совместные проекты.
Торговые дома Республики Башкортостан существуют и в других странах, например, в Болгарии и Словакии.